为什么菌液pcr目的条带是对的,但是去测序就不对
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/11 07:42:12
我也遇到过这种问题,个人觉得可能是目的基因的定量引物不好,还有就是要优化PCR条件!
如果实验目的只是基因型鉴定,对PCR产物无其他要求的话,二聚体并非不能忍受,可以尝试以下方法优化反应条件:1.确定DNA模板为阳性,即确定含有目标序列;2.对退火温度设置温度梯度,琼脂糖电泳检测是否有
存在两种可能性,第一,引物设计错误,可以将引物和参考序列进行拼接后看看能不能顺利拼接,以及拼接之后的目的片段长度;第二,可能是非特异扩增,这个时侯如果确定引物位置没有问题,可以调整退火温度,以及PCR
如果PCR系统没有问题,很可能是质粒和染色体发生了重组.建议提细菌的genomeDNA做一次PCR.如果是阳性,就说明是这样.另外,还可以另挑几个菌落,重新提质粒扩增.
可以照胶的时候去调节亮度,对比和γ射线,然后会清楚一些.同时,你优化下PCR扩增条件之类的,提高扩增效率.希望对你有帮助.望采纳.再问:感谢回答,我会试试调节亮度。请问,这跟电泳时使用的染色液有关系吗
高手们好.最近做酶切连接转化,最后做鉴定时,以菌落为模板进行PCR时可以见到有目的条带;当把菌落接种到LB液扩菌后,以菌液为模板进行PCR时却什么东东都没有?请问会是什么原因啊?多多指教啊!建议重新以
假阳性1.平板是否加抗性?2.引物设计是否有问题?3.载体自连现象是不是很严重?建议做个对照4.菌落pcr条件是否合适?
另一条带在目的条带的上边且比较模糊的话,可能是引物二聚体,如果另一条也很明亮狭窄的话,估计是引物有错配.
菌落PCR的假阳性高很可能是因为你做PCR的循环数过大,我们实验室一般对于高拷贝数的质粒,循环数不会超过25个,一般用25个.我知道一家做这些,[威斯腾生物].感觉还可以
这很正常,一般做蓝白斑挑斑会更精确,不过现在的连接酶成功率很高,不少已经达到90%以上,但仍然存在只转化了质粒而未连接成功目的条带的菌落.所以挑斑时一般要多挑几个,而且选单菌落,可以画圈圈分散开来挑斑
1.先看下PCR电泳图里杂带多不多,若有的话很可能非特异性扩增了2.若条带干净,仍然有可能存在非特异性扩增,引物特异性不高导致竞争结合可将DNA直接酶切看是否能切出你的目标片段3.序列比对结果不能只看
问题很多啊.或者是你的PCR仪需要进行荧光校准(如果其他探针也没有信号的话),已经不能收集荧光信号了.或者是你的探针本身就有问题,合成的不好,信号很弱甚至没有信号.或者是你的探针存放时间太长,存放条件
一个可能原因,DNA结合了蛋白质,所以跑不出去.加loadingbuffer后加热(90度以上)一下再上样试试.另外一个原因,你的产物特别大(不一定是目标产物)再问:我做的是菌落PCR电泳检测结果,我
1、内参没有被扩增出来2、电泳时内参没加loadingbuffer或染料
恐怕还是cDNA的问题,actin因为量比较丰富,所以即使破坏一些仍能P出来,但你的目的基因就不同了
酶切位点消失啦,测个序看看.再问:测序了,说我的链接质粒没有信号再答:重新做吧,多半不对!
可能是菌的基因组DNA,不过基因组DNA是很大的,不只2k还有可能呢,是引物特异性不好,从转入质粒上克隆出了你的目的片段,但从菌基因组或者质粒序列上扩出来一个非特异
原因有很多,1,PCR出了问题,2,跑胶的缓冲液出了问题3,MARK溶液中的DNA被降解了4,操作时间太长,DNA被降解
PCR条带不够亮,说明扩增效率不高.一方面可能是你的引物设计的不够好,导致扩增效率低;二是引物的退火温度,你可以做个温度梯度PCR摸索下最佳退火温度,这样可以提高引物扩增效率.三是,DNA模板,浓度过
首先怀疑,特异性不好,解决办法:1,可能是模板量过高,降低模板浓度10-1000倍;2,适当提高退火温度1-3度,或者先用高于你以往退火温度的1-3度先p上5个循环,再用先前温度p剩余的循环(也就是在