基因不同variant的引物设计
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/19 19:54:02
如果实验目的只是基因型鉴定,对PCR产物无其他要求的话,二聚体并非不能忍受,可以尝试以下方法优化反应条件:1.确定DNA模板为阳性,即确定含有目标序列;2.对退火温度设置温度梯度,琼脂糖电泳检测是否有
不好意思,我没设计过引物,不过建议你到生物秀或是小木虫的论坛去看看,那里有很多这样的问题的
在这个专利文件里面有全长,引物你自己设计吧
你的realtimePCR扩增的是cDNA啊,因此用CDS序列啊.
你看,你分别获得了1-1200nt以及1000-1400nt这两段序列,那么中间有200bp长度的序列是重叠的,对吧?也就是说你已经从序列信息上获得了这个CD区所有的序列信息.如果你只是需要序列信息的
理论应该用CDNA进行因为设计,但要保证你提取的mRNA的质量,尽量减少降解.可以在原序列基础上先写出互补序列再进行引物设计.
variant是默认类型,可以接受任何类型的数据.这在编程中有时会很有用.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank
具体的中文怎么表达我不清楚,不过mRNA有transcriptvariant表明最终翻译表达的蛋白可能有不同的isoform,这些isoforms有同样的名称,他们的基因名称一样.比如一个m基因,它的
一条引物应该与A链一端的序列一致;令一条引物应该与B链在令一端的序列一致.走向应该都是从5’到3‘向基因内部走.
您应该使用巢式PCR来做这个实验.无论您是先提RNA再做反转录,还是直接从DNA中获得基因,考虑到模板的复杂性,都应当使用巢式PCR.建议您先从目的基因的上下游设计一段引物,即外引物,再根据目的基因上
mutation:1.change;alteration;变化~转变~2.neworganismresultingfromsuchachange;变种~突变体~variant:thingthatdif
首先,上下游引物20多个bp,4种碱基,想在基因组上找到2个一样的排列的情况是几乎不可能的事.所以,你只要确定了上下游引物,那么得到的就一定是你要的基因.其次,能问这个问题,说明lz对pcr的原理貌似
你可以找到BAX的基因序列么?如果可以,那么你可以对比不同的转录本确定外显子和内含子的位置,然后依据你所要研究的对象,在不同的外显子上设计引物.不过话说回来,你做的是表达分析,你只要针对你感兴趣的转录
普通PCR是基因克隆的基础,原理一致.基因克隆在于所扩的序列是未知的,现在很多生物的全基因序列已经公布,多重序列比较设计简并引物,克隆出保守区域的片段,在通过RACE等方法把上下游的序列扩出来.
和从哪设计引物没关系如果编码区有突变的话那就肯定不行的最简单的就是拿去测序CDS区完全正确就可以了验证功能的话就做western以及检测该基因下游targets的表达量比如它可以促进A的表达就转染细胞
variant是指具体事物variable是状态
我有一个关于primer5的使用技巧的文档,你需要的话可以给你,里面介绍很详细,其实引物设计都是很简单的,自己多试试就很简单了
那是显然的,所以在提rna做pcr的时候,如果里面混了基因组dna,那就有可能导致假阳性再问:谢谢,但是这不是我想要的答案。请问做半定量RT-PCR的引物怎么设计?可以设计在基因的非翻译区,然后扩非翻
没有必要那么麻烦,只要选定自己扩增的片段,从两端选18-25bp长度的序列作为引物就可以了,只要不形成典型的环,或者两条引物严重配对就可以了(50%以下就可以)最重要的是能扩增出来,别的考虑那么多也没