如何从NCBI上找到蛋白激酶的序列
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/11 07:05:40
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
蛋白激酶是一类重要的激酶,在信号转导中主要作用有两个方面:其一是通过磷酸化调节蛋白质的活性;其二是通过蛋白质的逐级磷酸化,使信号逐级放大,引起细胞反应.蛋白激酶种类繁多,本篇重点介绍PKA,PKB,P
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
首先打开NCBI网站首页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的基因序列名称,点击search就行.然后会出来很多结果,因为很多基因是同名的,或是一个基因在不同种属中不一样
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov,上面搜索条,下拉菜单选gene,后面输入你要找的基因名,加种属名,如人的加homo,点search,选择你要的基因进入,里面有详细介绍,下拉
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
现到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene然后输入ABL[sym],代表你是在查找ABL为缩写符号的基因就会得到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gen
NCBI功能详介和使用方法
找到要的序列,然后最上面有一个“sendto”的下拉菜单,里面有TXT、File、Clipboard三个选项,一般选择以TXT保存或者File保存.
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取.NCBI的GenBank提供了两个投递方式:1、在线投递-BankIt,特点是比较方便.2、本地投递文件生
我预测蛋白质结构域都是在smart上预测的,是个在线的网站,基本还是蛮准的,另外还有许多网站提供在线预测,不过我只用过smart
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
1打开NCBI主页2左边search里面选择GENE右边的对话框里输入你想要的基因名称3在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homosapiens是人Feliscatus是猫.选择你想要的种属
向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin.用那种办法,根据不同的需要.BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.g
GT-AG规则存在着一定的变异.近缘基因组中的同源基因一般有保守的intron/exon结构,可以帮助鉴定内含子和外显子的边界.
可以试试blast程序,在主页的右上方
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用
第二条结果.查找方式:选择GenomeProject,查找arabidopsisthaliana