blast序列比对同源性97%-搜答案-大师作文网

能不能构建进化树来分析同源性呢?我做过NJ树MP树之类的,可以通过与其它近缘生物的序列一起构建系统发育树来比较,不过我做的都是一个属内的或者是两个相近的属的

不太懂你的问题.是要将某一种植物与拟南芥对比吗?没记错的话是用扩增18SrDNA的引物来做PCR,然后进行测序,测序结果来和拟南芥的18SrDNA序列进行比对.

粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做

ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection（nr/nt）选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问：这一

1）输入fasta格式序列2）选择核算比对

序列比对结果有一个identify参数,identify参数有一个是数值结果,有一个是百分数的结果.是否具有同源性以identify参数的百分数结果为准,如果达到40%或者以上就叫做有同源性,中文就叫

相似性和同源性：相似性（similarity）和同源性(homology)是两个完全不同的概念.同源序列是指从某一共同祖先经过趋异进化而形成的不同序列.相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相

1.先看下PCR电泳图里杂带多不多,若有的话很可能非特异性扩增了2.若条带干净,仍然有可能存在非特异性扩增,引物特异性不高导致竞争结合可将DNA直接酶切看是否能切出你的目标片段3.序列比对结果不能只看

不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.

$ grep-n“seqs1” |less如果想输出到某个文件|less改为>youwant.txt再问：��д��ϸ��ҵ�perl��Ϊ0.000000

把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦

将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据

直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问：我只是在做我的本科生毕业论文，所以不咋看得懂，我现在主要就是结果那块看不懂，不知道怎么分

看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.

同种属同一基因相似性99%以上,只有个别密码子第三位突变,需要翻译为蛋白序列比对,相同即为同一基因..

这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,

可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多

可以用好多软件啊,像DNAman之类的好多啊.

你是在生物的种类鉴定上看到的这个吧.“基因同源性若低于97%的话,则可被认定为新种”这样的吗?嗯……是这样的,在做新物种的鉴定时,除了通过观察形态和生存之类的条件,还可以从基因方面进行考察.通常是选取

blast序列比对 同源性97%