blast序列比对Query cover

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/18 08:10:25
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关于DNA序列在NCBI上比对的问题

正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题

ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection(nr/nt)选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问:这一

ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南.

1)输入fasta格式序列2)选择核算比对

您好,看到您对“如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性 ”问题的回答,想必阁下对两种

序列比对结果有一个identify参数,identify参数有一个是数值结果,有一个是百分数的结果.是否具有同源性以identify参数的百分数结果为准,如果达到40%或者以上就叫做有同源性,中文就叫

如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性

不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.

生物序列比对的研究意义是什么?

生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达结构和功能的生物信息.生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析,也就是研究新的计算机方

编写一段关于blast提取序列的Perl语言

$  grep-n“seqs1” |less如果想输出到某个文件|less改为>youwant.txt再问:��д��ϸ�����ҵ�perl��Ϊ0.000000

NCBI上怎么用BLAST对比序列

把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦

BLAST搜索同源序列与用entrez搜索同源序列有什么差异

Blast出来的是一系列和你提供的序列很相似的已知序列~并进行比对,列出相似度等信息.Entrez是和PubMed连锁的,一般是通过已知核酸序列查蛋白产物,和相关文献什么的~

有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教

直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问:我只是在做我的本科生毕业论文,所以不咋看得懂,我现在主要就是结果那块看不懂,不知道怎么分

克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析?

看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.

16S rRNA怎样进行序列分析比对

百度EZTaxon,进去之后注册,登录,左边IdentifyStep1在空白处按照如下格式输入>序列名称(自己写,能认识就行)序列(测序结果,只含ATCG)如:>E.coliATCGATCG...St

如何用blast检测引物序列结果好不好

对上面这个页面进行一下必要的介绍:BLAST的这个页面主体部分(左面)包括了三部分:BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂

已知基因序列,mrna序列,怎样用blast分析内含子和外显子

使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA

BLAST 蛋白比对求助

同种属同一基因相似性99%以上,只有个别密码子第三位突变,需要翻译为蛋白序列比对,相同即为同一基因..

细菌16S rDNA 序列比对,

这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,

基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗?

可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的

NCBI中双序列比对BLAST结果相关问题

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多

怎样分析基因序列比对结果

可以用好多软件啊,像DNAman之类的好多啊.

用BLAST对比了两个蛋白序列的相似性

部分区域相似,且相似度很低.分值越高越相似