大师作文网blast序列比对结果Query cover是什么
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/09/30 13:31:45
ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection（nr/nt）选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问：这一
1）输入fasta格式序列2）选择核算比对
序列比对结果有一个identify参数,identify参数有一个是数值结果,有一个是百分数的结果.是否具有同源性以identify参数的百分数结果为准,如果达到40%或者以上就叫做有同源性,中文就叫
1.先看下PCR电泳图里杂带多不多,若有的话很可能非特异性扩增了2.若条带干净,仍然有可能存在非特异性扩增,引物特异性不高导致竞争结合可将DNA直接酶切看是否能切出你的目标片段3.序列比对结果不能只看
不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.
$ grep-n“seqs1” |less如果想输出到某个文件|less改为>youwant.txt再问：��д��ϸ�����ҵ�perl��Ϊ0.000000
你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链（即你目的基因的编码链的互补序列）,而NCBI中提交的序
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问：我只是在做我的本科生毕业论文，所以不咋看得懂，我现在主要就是结果那块看不懂，不知道怎么分
看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
没事,这个可以,你应该是把设计的上下游引物都进行了比对,前两个比对结果应该就是上游、和下游引物,假设你第一个结果是上游,第二个结果是下游.那么第三个结果也就是下游比对结果,下游结合的位置距离上游、下游
对上面这个页面进行一下必要的介绍：BLAST的这个页面主体部分（左面）包括了三部分：BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂
同种属同一基因相似性99%以上,只有个别密码子第三位突变,需要翻译为蛋白序列比对,相同即为同一基因..
这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,
可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
可以用好多软件啊,像DNAman之类的好多啊.
你确定是两个不同的基因吗?会不会是同一基因的不同的可变剪切类型再问：是根据模式生物的不同基因的片段对得到的转录组进行blast查找，结果显示找到的是同样的序列。再答：或者就是你的那两个的基因不完整，可
部分区域相似,且相似度很低.分值越高越相似