blast比对query cover表示什么
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/18 07:58:33
n.爆炸;冲击波;一阵vi.猛攻vt.使枯萎;损害;爆炸联想:explodewinddamage
ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection(nr/nt)选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问:这一
怎样用primer-blast设计引物http://wangyufeng222.blog.163.com/blog/static/128222070201110511213331/
1)输入fasta格式序列2)选择核算比对
序列比对结果有一个identify参数,identify参数有一个是数值结果,有一个是百分数的结果.是否具有同源性以identify参数的百分数结果为准,如果达到40%或者以上就叫做有同源性,中文就叫
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
不能,要用多序列比较程序,如clustalw.
不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/关于Blast的文章:http://liucheng.name/tag/blast/
你玩的很开心吗?嘿嘿,这是口语中常用的
BLAST是用来比对序列的相似度的.
n.爆炸;巨响;一阵(强风);严厉的批评;愉快的经历v.爆破;摧毁;发出巨响;用力撞击;批评
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问:我只是在做我的本科生毕业论文,所以不咋看得懂,我现在主要就是结果那块看不懂,不知道怎么分
看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
没事,这个可以,你应该是把设计的上下游引物都进行了比对,前两个比对结果应该就是上游、和下游引物,假设你第一个结果是上游,第二个结果是下游.那么第三个结果也就是下游比对结果,下游结合的位置距离上游、下游
同种属同一基因相似性99%以上,只有个别密码子第三位突变,需要翻译为蛋白序列比对,相同即为同一基因..
可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
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