测序后序列分析
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/11 23:46:48
很多的软件都可以分析,百度下,武汉淼灵生物
能不能构建进化树来分析同源性呢?我做过NJ树MP树之类的,可以通过与其它近缘生物的序列一起构建系统发育树来比较,不过我做的都是一个属内的或者是两个相近的属的
看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtalX软件,要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fast
(1+0.079)(1+0.045)(1+0.2)=1.353066总共5年,将其开5次方得:1.062341再减去1,得:0.06234于是,所求平均增长率为:6.2341%
做时间序列分析,最强大最方便的是EViews,包括单位根检验、VAR模型、协整检验等等.需要的话,数据发给我,我可以帮您.
我认为主要有两点,一是DNA序列比A.a序列长2倍,包含的信息量更大,易于找出物种间的差距.二是碱基只有4种,而A.a有20种(仅限这一情形,实际的碱基与氨基酸的种类要远远大于上述情况)所以在分析的时
可以用生物信息学的方法进行分析,例如:多序列比对~用到的软件是Bioedit或Clustalx1.
因为一般的做DNA相关的都是为了能更好的分析蛋白及表达蛋白,开放阅读框的DNA序列编码的就是你所要分析的蛋白再问:就只是分析开放阅读框里面的吗?
目的是找出功能基因序列,进一步了解这些基因的功能,通过调节基因表达与沉默可以调节这个功能的表达
1.测序最好克隆到载体后进行,比直接测PCR产物好2.测序短,说明你的样本里有抑制剂,比如EDTA等.样本要用水稀释,不能含有抑制剂3.同源性只有34%,说明不是同一种属的.4.如果有好几个,那你可以
GENSCAN-是一款不错的在线工具,适合在DNA上查找基因序列,预测基因等.序列分析的话,问题很泛泛,不过你要是用BLAST可以去看看NCBI上的在线BLAST,进行序列比对来发现有用的信息http
看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中
使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA
做回归分析和格兰杰因果检验就可以啦
最常用跑电泳和测序
ncbiblast中的protein
可以用好多软件啊,像DNAman之类的好多啊.
就是一种鉴定遗传物质是不是同源的吧
1常见单一限制性酶切位点:HindIII495;NdeI453;2.1〉提取基因组DNA;2.2〉用实验室常用的而序列上没有酶切位点的几种酶分别酶切基因组DNA,如EcoRI/BamHI/SacI/X