细菌16s序列提交NCBI
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/11 08:58:16
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
一般进入NCBI界面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo,查询就可以导出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超链接查找,或者把GENE改成protein,同样查找
你说的应该是野猪(Susscrofa)的基因组从以下链接的图中可以看到complement那段说的就是一个基因名字为LOC100622239,这个基因的特点就是,相对GUCY1A3而言,它是向另一个方
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取.NCBI的GenBank提供了两个投递方式:1、在线投递-BankIt,特点是比较方便.2、本地投递文件生
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
就是通过测定16srRNA的序列来对病原菌进行定种.16srRNA鉴定是很经典的微生物定种方式啊.再问:有没有这方面的资料推荐,非常感谢再答:这个太多了,谷歌学术里一搜一大把。
提取细菌总DNA再用细菌16srDNA通用引物PCR出16s序列,电泳找到所需条带,回收然后送到测序公司测序
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中
哪一个转录因子?不同的基因有不同的序列,转录因子也是某些基因表达的某类蛋白,只是这些蛋白能够结合到其他基因的转录调控区域(如启动子),从而调节其他基因的转录.作为某个特定的转录因子,必须明确它的名称(
这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,
你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问:下面一大块的都是
我的也是这样写的,师兄说是个固定的几句话,应该没事的,反正上面序列号已经给了.
你进入Protein的Entrez,用蛋白质AccessionNumber查找到蛋白质之后会给你连接的,每个蛋白质不一样如果没有NC号,就用BLAST搜索,使用tblastn工具,最前面的一个就是相应
Yes线粒体的基因么?这两个基因,貌似在大部分物种中都是单外显子,没有内含子的.至于鱼类中如何按理说你最清楚才是,可以用实验来验证的:以DNA为模板扩增测序,看产物有否变长...如果你的序列本来就是直
你翻译错了,有一下几个可能,一是你的“基因序列”是基因组DNA序列,包含有内含子;二是你翻译序列的时候,选用了错误的读码框位置,往前、往后挪1个碱基尝试一下;三是你的序列在某一个位置有插入删除变异或错
我认为有必要上传,毕竟品种不一样,上传的时候标记清楚即可