ncbi中blast有什么用
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/10 01:19:38
在生物医学信息学领域,数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同,如果要问NCBI过去,现在或将来会有多少数据库,恐怕连NCBI自己都说不清楚.要是一个一个数据库讲下来,9999个字肯定不够用.这里有
在Genbank中,每条登陆上传的核酸序列都有一个唯一的ID号,可以凭借此ID迅速找到该核酸序列.
各自的主要关注点不同!再问:你试过?
带引号的都是一些数据库中的编号最前面几行是基因的名称染色体位点以及相关的文献的一些信息
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/关于Blast的文章:http://liucheng.name/tag/blast/
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据
Blast出来的是一系列和你提供的序列很相似的已知序列~并进行比对,列出相似度等信息.Entrez是和PubMed连锁的,一般是通过已知核酸序列查蛋白产物,和相关文献什么的~
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问:我只是在做我的本科生毕业论文,所以不咋看得懂,我现在主要就是结果那块看不懂,不知道怎么分
先到:选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
看性质可以翻译一下在看嘛
attack攻击;抨击,这个词带有攻击意味,有敌意burst爆发,爆炸,重在表现突然意思split分开,分离,裂开,与其余三个词意义本身就不同blast爆炸,冲击波,重在表现程度比较重.
PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
以下是英语教网的解释.Explosioniswhenthebombgoesoffandblastisthenextreaction.所以explode是爆炸的前段blast是爆炸後下一段的反应.
在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18记作3.2E18,即E=Exponent,指数;幂再问:5e-04,即表示5×10^-4。谢谢再答:嗯,对的!
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/,是一个基因库,可以查询已知序列,还可以查找文章,登记序列等等,不管是筛选细菌还是做分子实验,都是很有用的网站
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多