NCBI氨基酸序列同源性分析

能不能构建进化树来分析同源性呢?我做过NJ树MP树之类的,可以通过与其它近缘生物的序列一起构建系统发育树来比较,不过我做的都是一个属内的或者是两个相近的属的

不太懂你的问题.是要将某一种植物与拟南芥对比吗?没记错的话是用扩增18SrDNA的引物来做PCR,然后进行测序,测序结果来和拟南芥的18SrDNA序列进行比对.

粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做

ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection（nr/nt）选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问：这一

一般进入NCBI界面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo,查询就可以导出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超链接查找,或者把GENE改成protein,同样查找

你说的应该是野猪(Susscrofa)的基因组从以下链接的图中可以看到complement那段说的就是一个基因名字为LOC100622239,这个基因的特点就是,相对GUCY1A3而言,它是向另一个方

首先说明,如果想从蛋白质入手找基因序列,由于同源性较低,不推荐这么做,但是你执意如此,不是没有办法,就是成功率比较低.第二,蛋白质N端起始都是M,你检测出的D是因为没有到起始位置,还是蛋白质有后修饰加

把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦

很多蛋白酶的酶切位点是有一定特点的.例如胰蛋白酶水解赖氨酸和精氨酸的羧基形成的肽键,糜蛋白酶水解含有苯丙氨酸,络氨酸,色氨酸等残基的羧基形成的肽键,等等.据此,可以选择相应的蛋白酶经行酶切.

就是分析两个或多个基因的DNA序列相似程度.从进化论的角度来说,序列相似的基因就是由同一个祖先基因经过长年累月突变转变而来,所以序列相似的基因又被称为同源基因,分析基因的相似程度也就被称为同源性分析.

将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据

古生物学：指同类生物的对应器官之间的相似,它们来自一个共同的祖先.生态学：来自于共同祖先的生物类群的性状特征的相似性.生物化学和分子生物学：从共同始祖分子经趋化与进化,在序列或结构上存在的相似性.遗传

将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中

把两个基因组序列,贴到BLAST里面就可以了

选核苷酸那个nucleotide在basicblast里面再问：请问是nucleotidecollection，选择这个对吗？还有blast之后，要建树嘛，怎么选择同源性菌株呢？再答：嗯对的建树时同源

NCBI主页,选gene/proteindatabase,查newcastleF,选择该基因直接连接到其基因网页：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db

哪一个转录因子?不同的基因有不同的序列,转录因子也是某些基因表达的某类蛋白,只是这些蛋白能够结合到其他基因的转录调控区域（如启动子）,从而调节其他基因的转录.作为某个特定的转录因子,必须明确它的名称（

ncbiblast中的protein

你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问：下面一大块的都是

你进入Protein的Entrez,用蛋白质AccessionNumber查找到蛋白质之后会给你连接的,每个蛋白质不一样如果没有NC号,就用BLAST搜索,使用tblastn工具,最前面的一个就是相应