将扩增的序列进行blast,相似性偏低,要如何处理?

用BLAST对比了两个蛋白序列的相似性 如何在NCBI上寻找要扩增的序列? 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗? 如何比较两段DNA序列的相似性 如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 对于一段有重复序列的片段如何扩增,只是一个基因的中间的部分序列,准备扩增做overlap. 对PCR扩增后的目的基因如何进行提取 怎么比较两段DNA序列的相似性 进行PCR扩增时为什么要将目的基因连到载体上?直接对其进行扩增不行吗? 如何将植物基因序列与拟南芥进行同源性分析? 编写一段关于blast提取序列的Perl语言