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反转录中 RNA 和 引物的量

来源:学生作业帮 编辑:大师作文网作业帮 分类:数学作业 时间:2024/11/07 10:47:49
反转录中 RNA 和 引物的量
在用promega的MMLV做反转时,加OLIGO DT18时,说明书说每微克RNA加0.5微克OLIGO DT,我用了2ugRNA需要加 1ug的 oligo dt 18,但是我的oligo是TAKARA公司的,它的规格是50微摩尔/升的.我该怎么换算?你们平时做的时候,RNA的量和引物的量是什么比例?
反转录中 RNA 和 引物的量
takara的试剂盒里推荐的使用量是每20ul体系使用total RNA1ug,浓度为2.5uM的oligo dt 1ul.同时还可以加入随机引物或者下游特异性引物,可以提高反转录效果.
再问: 你好,takara的 RNase inhibitor 给的反转录的参考是: 20ul 体系 用 总RNA 1ug,但用的引物 oligo dt 18 是 50pmol,这和 你上面说的反转的试剂盒 20ul 体系 用 总RNA 1ug,但引物 oligo dt 却只用了 2.5 pmol, 这相差也太大了吧?
再答: 你这么一问给我也问住了。我也查了一下你说的那本说明书,上面并不详细,也许是没有写明oligo dt 18的用量,而只是写random 引物的用量。oligo dt 只能作用于带polyA尾的mRNA,而总RNA中mrna占的量应小于5%吧。所以用量少于其他的反转录引物也是合理的(random引物和特异性引物都是可以完全作用于总RNA的。)。不知道你是否同意我的解释。
再问: 你好,非常谢谢你的回答。你说oligo dt 只作用与mRNA,大概5%,那你看 :你说的那个试剂盒的参考 是总RNA1ug,加2.5pmol。 takara 的 Ribonuclease Inhibitor 的说明书给的参考是 模板RNA 1ug 加 oligo dt18或random primer(6-9mer)50pmol。问题是不是在这个总RNA 和模板RNA上, 这个模板RNA难道是指 mRNA 的量么?你看 2.5pmol 除以5%=50pmol,正好是 说明书上的 模板RNA 1ug 需要加的oligo的量。你说这样对么?
再答: 你好,其实我不是这么理解的,我是认为那RNase inhibitor上的说明书上写的不完善,在oligo dt18的后面没有写用量,random primer(6-9mer)50pmol这是应该的,因为其他的试剂盒里推荐的random primer使用量也是20uM加1ul(即20pmol)这就和50pmol没有数量级的差别,合理的差距。而1ug total RNA中只有小于5%的mRNA,所以这种只作用于mRNA引物的使用量也要小到相应的数量级,这也是合理的,这也只是我自己的一点看法,希望对你有帮助。