怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理?
来源:学生作业帮 编辑:大师作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/09/25 15:26:40
怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理?
比如有序列:
>gi| test
KHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
>gi| test
MHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
NHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
我想一次处理一条,应该怎么写?
比如有序列:
>gi| test
KHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
>gi| test
MHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
NHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
我想一次处理一条,应该怎么写?
你指的每个序列都是以>gi| test开头的么?
那可以按行读进来,判断该行是否是>gi| test,如果是,接下来的每一行都单独处理,直到读到下一个>gi| test为止.
那可以按行读进来,判断该行是否是>gi| test,如果是,接下来的每一行都单独处理,直到读到下一个>gi| test为止.
求一段perl分割fasta中DNA序列的代码 fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释,
怎么把自测序列转换成fasta格式的啊
有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!
手头现有1个DNA文件(fasta格式),序列比较长,可能有100kb,现想从中提取特定位置的序列.
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perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.
大家谁知道怎样用perl解决生物问题
perl 中的my (@list) =
perl $@
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