如何进行系统进化树的构建和分析?我这有测好的基因序列,但是不知道该怎么构建系统进化树,
来源:学生作业帮 编辑:大师作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/09/30 01:43:55
如何进行系统进化树的构建和分析?我这有测好的基因序列,但是不知道该怎么构建系统进化树,
首先你需要一个能够对序列进行编辑的软件(比如Mac系统的MacGDE、WIndows的BioEdit、Mega、Genuis、ClusterX等)对整个数据库排序(Alignment),就是把相似的位点放到一起去.
同时你要决定构建树用的方法,一般来说用Maximum Likelihood(Paup)、Bayesian(Mr Bayes),不过在此之前先用Neibour-Joining(快速,不准确)看一看大概情况也是必要的
然后就是把数据库里有Gap的部分切掉,然后放到构建树的程序(Paup、MrBayes等)去做树
具体方法见那些软件的说明书……
同时你要决定构建树用的方法,一般来说用Maximum Likelihood(Paup)、Bayesian(Mr Bayes),不过在此之前先用Neibour-Joining(快速,不准确)看一看大概情况也是必要的
然后就是把数据库里有Gap的部分切掉,然后放到构建树的程序(Paup、MrBayes等)去做树
具体方法见那些软件的说明书……
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