如何对16S rDNA序列进行BLAST

你可以看软件中help.简单说,将测序的序列打开,找到你翻译的atg起始,到终止密码子,copy到新的空白文档.load该文档到channel,点击protein一栏中的translation.就有啦

不太懂你的问题.是要将某一种植物与拟南芥对比吗?没记错的话是用扩增18SrDNA的引物来做PCR,然后进行测序,测序结果来和拟南芥的18SrDNA序列进行比对.

粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做

还需要和菌种的形态学观察、生理生化结果（参照《伯杰氏细菌手册》第8版相关内容进行）综合参考才能得出结论.再问：好比说我现在16srDNA鉴定到了属，接着就从这个属开始做一些生理生化实验，最后得出结果吗

是不是可以将其中一个做因变量一个做自变量做线性回归然后输出结果里就能看到F检验值了

都用原序列你可以看看其他发表的论文也是这么操作的再问：谢谢。那如果协整检验中，OLS的回归残差不能通过ADF检验（该检验与此前的检验设置都是相同的），那就是证明不存在协整关系，失败了吗？再答：是的

北京三博远志16srdna测序/鉴定说明：1、样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA.2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul.3、鉴定结果一

首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是

首先说一个知识点,就是用数组操作二叉树(把堆看成二叉树容易理解)一个数组a[n],a[0]不考虑舍弃,a[1]为根节点那么,a[i]的两个孩子节点就是a[2i]和a[2i+1](不理解的话自己做下实验

一是模型有所欠缺如滞后变量不够建议增加滞后变量再删减在拟合二是,数据变动异常值较多或区间过长增大误差三是,使用静态预测而非动态预测

你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因（ortholog）然后再做进化树那种吧.进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是mu

建立回归模型即可相关性可以通过相关分析来判断我经常帮别人做这类的数据分析

看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.

--16srDNA不是提取出来的~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA.然后你把PCR产物纯化一下送交测序公司测序,

要想合成不是自然存在的蛋白质其实就是根据已知蛋白质然后合成的氨基酸逆过程蛋白质合成氨基酸是先去除空间结构然后水解成多肽然后解旋转录成mRNA再继续而人为去合成蛋白质也需要先有mRNA根据模板合成DNA

百度EZTaxon,进去之后注册,登录,左边IdentifyStep1在空白处按照如下格式输入>序列名称（自己写,能认识就行）序列（测序结果,只含ATCG）如：>E.coliATCGATCG...St

V3区是在通用引物所扩增的序列的一部分.V3区引物的变异性相对于通用引物27F/1492R而言更高.

没有办法.时间序列要求较大样本的.当然,如果要求不是太高,比如不做协整检验,只用普通的回归,可以做一下.但总的来说,样本太小,影响结论的可靠性.统计人刘得意

双向测序得到的两个序列如果有重叠区的话,那么可以做拼接.另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较,通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列.做拼接有专门的软件,如DNAstar里面的Se

超过11位的,会自动转换为科学记数.下面提供两种办法对12位及12以上的数字进行序列填充.比如：123456789010011234567890100212345678901003.（1）利用公式,在