引物多少个碱基不配还能扩增条带
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/11 08:07:50
如果实验目的只是基因型鉴定,对PCR产物无其他要求的话,二聚体并非不能忍受,可以尝试以下方法优化反应条件:1.确定DNA模板为阳性,即确定含有目标序列;2.对退火温度设置温度梯度,琼脂糖电泳检测是否有
因为DNA聚合时需要3‘OH,这个只能由引物提供(没原因,就因为是那样).这个引物是一小段RNA,引物绝对是RNA,而不是DNA.看看DNA复制需要什么酶就知道了,需要依赖DNA的RNA聚合酶(DDR
1.引物设计不够特异,检查你的序列,去BLAST看看.2.退火温度过低,检查你的引物的Tm,检查你的程序设置.
如果是双链,第一次循环要1对引物,第二次要2对,第三次4对,第四次要8对.总共15对.上下游引物各15条.如果是单链,第一次循环要1条引物,第二次要1对,第三次2对,第四次要4对.总共7对半.上下游分
当然可以咯,不过我没明白为什么上游引物GCrich跟分两段扩增有什么关系,1.2K一次扩增是完全没有问题的,如果上游引物出现GCrich的情况,那么可以考虑在更加上游的地方设计引物啊,在这个基因外测的
这个很正常,引物本身的结构和模板的结合牢固程度,就会影响扩增的效率,导致扩增出来的片段亮度不同.
为什么只有10个碱基配对呢?引物总长多少?再问:加上3bp保护碱基和9bp酶切位点。总长19bp再答:晕死,这么短,一般引物都是18-20bp,再加上保护碱基和酶切位点好吧再问:好吧。谢谢你啊!又合成
16个退火温度太低了吧18-20不错再问:我需要使退火温度低点。16个会导致非特异性扩增吗再答:会不会有非特异性扩增得去blast一下才知道不过肯定是越短概率越大就是
我也遇到过类似的问题,根据同源性设的引物来PCR,结果出来的是非特异条带,要不就是没有.还是得优化条件比如引物和模板的比例
原因很多,你是否提到了DNA,可以将你跑的DNA直接跑胶看看,到底有没有条带;PCR扩增的程序有没有问题,或者引物是否有问题,可以找个对照DNA试试,相同扩增条件下,是否扩出条带,如果扩不出来就用可能
一般是不要切胶,直接把第一次的PCR产物取一微升作为底物,再用第二队引物扩增一次,如果引物设计正确,就只会出现一条条带了.如果要计算大小,就按楼上说的.但是雀式pcr的目的就是至少做2次,以保证特异性
用dl2000marker的话,在750bp(从上往下第三条带)和1000bp(第四条带)之间,
PCR产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子.也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带.如果只是进行PCR产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了.问题
这要具体分析.一种可能是你的PCR产物是非特异性片段,所以长度不一,这可以通过和你预期PCR产物的长度进行比较来判断.另一种可能是该基因在不同情况下有不同的剪接模式(alternativesplici
首先,我们来说一下PCR技术所用的酶.所用的酶是TaqDNA聚合酶,现在已知的所有的DNA聚合酶在使单个的脱氧核苷酸聚合的时候都有一个共性,它无法从头开始,只能在一段序列的末尾续接.在生物体内DNA自
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
你的引物怎么这么长?预变性94℃5min,变性45s,退火温度看你引物是怎么设计的了.你这么长的引物估计退火温度肯定是60℃以上了.退火45s即可.72℃延伸1.5min到2min.(pfu聚合速度大
如果引物序列,PCR体系,程序,以及所用的物种都和文献一样的话,可考虑两种情况:1.你所参考的文献真实度有待考量.2.你所提取的该物种DNA质量不好.需重新提纯.
我不了解你的实际情况,我给你几条建议:1.可能是内参引物有问题2.你扩增内参基因的PCR条件设计可能有问题,如Tm3.你用的是一块胶吗?加核酸染料了吗?
1退火温度不合适2引物不合适3模板有问题4酶由问题