NCBI blastx序列比对说明-搜答案-大师作文网

正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看

用contig1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Maxident均为96%.

你可以看软件中help.简单说,将测序的序列打开,找到你翻译的atg起始,到终止密码子,copy到新的空白文档.load该文档到channel,点击protein一栏中的translation.就有啦

觉得可能是theproteincoveragesummazer(pcs),这个我没有用过……

1）输入fasta格式序列2）选择核算比对

相似性和同源性：相似性（similarity）和同源性(homology)是两个完全不同的概念.同源序列是指从某一共同祖先经过趋异进化而形成的不同序列.相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相

不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.

生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达结构和功能的生物信息.生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析,也就是研究新的计算机方

动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?

首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是

你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因（ortholog）然后再做进化树那种吧.进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是mu

看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.

核酸序列保守性可以通过UCSC-blat功能或者ncbi-blast功能,前者可以连接到UNIPROT数据库相应蛋白.

DavidMount的书.这里有电子版：

百度EZTaxon,进去之后注册,登录,左边IdentifyStep1在空白处按照如下格式输入>序列名称（自己写,能认识就行）序列（测序结果,只含ATCG）如：>E.coliATCGATCG...St

这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,

可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多

可以用好多软件啊,像DNAman之类的好多啊.

找近缘种,越近越好,的那个基因都下下来ncbi或软件都可以比对,找高度保守区具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物,如果有四个是G,两个是A就选G,要是一半