NCBI的genbank里的CDS什么意思
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/17 03:21:49
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C
要确定一个ORF,我个人觉得需要确定上游是否有可能的启动子序列先分析启动子可能位置,再确定ORF.你可以把你克隆的片段上游2k以内的序列,用一些启动子分析软件找下,分析下可能的转录起始位点,再在下游找
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
Amphiprionfrenatus:白条海葵鱼(一种观赏鱼)voucherFMNHBus03-5T-128:编号FMNHBus03-5T-128bonemorphogeneticprotein4ge
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问:有没有什么详细的步骤啊,有点点看不懂那个网站。再答:NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面
GenBank序列数据库GenBank是美国国立卫生研究院(NIH)维护的基因序列数据库,汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列.每个纪录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段.目前
好像用proteinworshop可以看
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
这是有可能的,因为NCBI数据库中没有该物种的序列信息,在综合楼上的,就可以了.
先到:选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取.NCBI的GenBank提供了两个投递方式:1、在线投递-BankIt,特点是比较方便.2、本地投递文件生
ncbi中也不是很多吧.那个里面的序列也都是人们提供进去的,有人研究过才有的,不是什么都能查到的百科全书.
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/进入NCBI,在AllDatabases下输入所要查的基因名称,例如NADPH,点search,会跳出很多信息,点击Nucleotide进入后会
当然是dna的啦,引物的设计有很多需要注意的地方哦,不然怎么有primer5、oligo7之类设计引物软件呢.
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用