primer5显示的下游引物是我们要合成得吗
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/11 09:04:28
不能需要注册器
你理解的没错.上下游引物同时用才能特异性扩增中间的那部分片段.
这个百度看一下吧
首先引物要跟模板紧密结合,其次引物与引物之间不能有稳定的二聚体或发夹结构存在,再次引物不能在别的非目的位点引起DNA聚合反应(即错配).围绕这几条基本原则,设计引物需要考虑诸多因素,如引物长度(pr
FPrimer:5'-TTGTAAAAAAATTAAATTAA-3'RPrimer:5'-CATATTTTAATTAATATTTC-3'你这个序列AT含量太高,尤其是5'端A有7个连续重复,引物本身很
引物设计原则:1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性.2、G十c含量
选取目标片段长度在80-250bp的引物,在回头BLAST,特异性良好的话就可以了,一般我会多设计几个,选取最好的那个~
为了形象,不写ATCG,换个比较容易看懂的形式模板是:abcd123.456efgh上游引物是:987ABCD123下游引物是:456EFGH789(这里为了方便观察下游印务给出了3’-5‘形式,通常
DNA或RNA都行.在体内DNA复制的时候引物为RNA.
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
一般引物设计时,要保证有12-15个碱基和模板完全匹配.而且引物的3‘端不能与其他位置配对,不能被封闭,最多封闭3个碱基.上游引物,下游引物,和他们之间尽量减少二聚体.保证GC含量在45-55之间.还
个人推荐使用PrimerPremier5
不能,扩增酶扩增一定长度后会脱落,但你引物的互补链没有扩增,无法呈指数扩增,30个循环后只是扩增30倍根本没产物
NCBI上面得到的是mRNA序列可以用oligodt反转录,也可以用与mRNA互补的特异引物来反转录再问:恩,特异性引物有一对,上游和下游,老师问我用上游还是下游,望回答具体点再答:反转录当然是下游了
引物有一条和模版的序列相同,而另一条和模版的序列反向互补,上游和下游是自己定的,分别位于模版的两端
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
一般认为Tm-5度.但是要看你的Tm计算方法,不同公司合成的引物得出的Tm都不一样,你可以做个梯度PCR看看最适退火温度,以后就有经验了.
这可能尽量减少DNA复制起始处的突变有关.DNA复制开始处的几个核苷酸最容易出现差错,因此,用RNA引物即使出现差错最后也要被DNA聚合酶Ⅰ切除,提高了DNA复制的准确性.
ISSR标记的做法ISSR(inter-simplesequencerepeat)是Zietkeiwitcz等于与SSR标记相比,ISSR引物可以在不同的物种间通用,不像SSR标记一样具有较强