用传统方法提取土壤基因组DNA,为什么就提不出来呢?
来源:学生作业帮 编辑:大师作文网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/11/12 05:43:02
用传统方法提取土壤基因组DNA,为什么就提不出来呢?
不知道你所说的传统方法是指什么.微生物与土壤混杂在一起,杂质很多,DNA就那么点,确实很容易提取失败.
建议在破碎细胞前先将土壤悬液充分摇匀,让微生物尽可能多的进入到悬液中,然后充分过滤,将土壤中较大的杂质过滤掉.
由于土壤中DNA量相对较少,所以细胞破碎步骤也很重要,本来就那么点DNA,如果细胞破碎不完全,又会损失掉一部分.
提取DNA时,如果传统方法不行,可以考虑用专门的土壤DNA试剂盒提取.
再问: SDS碱抽提法。过滤的话会不会把仅有的少量的DNA也过滤掉一些呢?
再答: 过滤必定会有一些损失,但不过滤杂质太多,更不好提取,损失会更多。 过滤前先充分摇匀的话,还是能保证悬液中的微生物数量的。
再问: 那用什么过滤好呢,就直接用膜还是?
再答: 可以用灭菌过的纱布、铁纱,我做过半年的土壤和其它环境基因组的提取,采用过这种过滤的方式,我感觉还是可行的。
再问: 恩。好的,谢谢!还有我们用的试剂盒能将一些样品中得基因提取出来,但另外一些就不行了呢?
再答: 不同样本性质不同,这也正常。 比方说样本时间放久了,DNA会降解;或者土壤土质不同,微生物含量有多又少,等等。
再问: 恩,好的.那我就先试试.谢谢!
再答: 不谢!祝你实验顺利!
建议在破碎细胞前先将土壤悬液充分摇匀,让微生物尽可能多的进入到悬液中,然后充分过滤,将土壤中较大的杂质过滤掉.
由于土壤中DNA量相对较少,所以细胞破碎步骤也很重要,本来就那么点DNA,如果细胞破碎不完全,又会损失掉一部分.
提取DNA时,如果传统方法不行,可以考虑用专门的土壤DNA试剂盒提取.
再问: SDS碱抽提法。过滤的话会不会把仅有的少量的DNA也过滤掉一些呢?
再答: 过滤必定会有一些损失,但不过滤杂质太多,更不好提取,损失会更多。 过滤前先充分摇匀的话,还是能保证悬液中的微生物数量的。
再问: 那用什么过滤好呢,就直接用膜还是?
再答: 可以用灭菌过的纱布、铁纱,我做过半年的土壤和其它环境基因组的提取,采用过这种过滤的方式,我感觉还是可行的。
再问: 恩。好的,谢谢!还有我们用的试剂盒能将一些样品中得基因提取出来,但另外一些就不行了呢?
再答: 不同样本性质不同,这也正常。 比方说样本时间放久了,DNA会降解;或者土壤土质不同,微生物含量有多又少,等等。
再问: 恩,好的.那我就先试试.谢谢!
再答: 不谢!祝你实验顺利!
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