已知部分基因序列,如何获得全长基因?
来源:学生作业帮 编辑:大师作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/11/12 09:36:35
已知部分基因序列,如何获得全长基因?
这是我们生物信息学中经常遇到的问题,最常用的方式就是就是到数据库--美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank--中用在线版的局部比对基本查询工具(Basic Local Alignment Search Tool,BLAST)搜索全基因组,下面是在线软件的网页链接:
(有时候百度会把链接屏蔽掉,那么就在谷歌中找NCBI,进入后在右边那一栏最下面有BLAST,点击进入,选择Basic BLAST中的nucleotide blast就可以到软件页面了)
把已知的基因序列贴入查询框,点击按钮"BLAST"
再问: 您能详细点说明吗?谢谢!
再答: 是没有进入BLAST页面?还是软件具体操作不了解? 进入BLAST页面的方法如上已详诉,软件操作详细步骤如下: 1.在"Enter Query Sequence"下面的输入框中贴入你已知的基因序列,如GTGCCGTGACTCGGATCGGGGGACCTCCCTTGGGAGATCAATCCCCCATCCTCCTGCT (不要过于太短,一般几十到几百nt); 2.设置参数:一般选一下"Choose Search Set"下的要搜索的数据库(Database),根据你的序列的物种和其他信息;其他默认.如果搜不到结果再试着改一下其他参数; 3.点击最下面的按钮"BLAST" . (我已经尽力了,具体细节还要靠你自己,希望对你有帮助!)
(有时候百度会把链接屏蔽掉,那么就在谷歌中找NCBI,进入后在右边那一栏最下面有BLAST,点击进入,选择Basic BLAST中的nucleotide blast就可以到软件页面了)
把已知的基因序列贴入查询框,点击按钮"BLAST"
再问: 您能详细点说明吗?谢谢!
再答: 是没有进入BLAST页面?还是软件具体操作不了解? 进入BLAST页面的方法如上已详诉,软件操作详细步骤如下: 1.在"Enter Query Sequence"下面的输入框中贴入你已知的基因序列,如GTGCCGTGACTCGGATCGGGGGACCTCCCTTGGGAGATCAATCCCCCATCCTCCTGCT (不要过于太短,一般几十到几百nt); 2.设置参数:一般选一下"Choose Search Set"下的要搜索的数据库(Database),根据你的序列的物种和其他信息;其他默认.如果搜不到结果再试着改一下其他参数; 3.点击最下面的按钮"BLAST" . (我已经尽力了,具体细节还要靠你自己,希望对你有帮助!)