大师作文网如何知道NCBI中某基因组的发表时间(或测序时间)
来源：学生作业帮 编辑：大师作文网作业帮 分类：数学作业 时间：2024/11/11 23:59:52
如何知道NCBI中某基因组的发表时间(或测序时间)
一般上面的时间是序列提交到NCBI上面的时间
比如你搜索Escherichia coli吧
在genomes里面会出现：
1 Genome:genome sequencing projects by organism
点1进去,出现：
Reference genomes:[see all organisms]
Escherichia coli str.K-12 substr.MG1655
Escherichia coli O157:H7 str.Sakai
Escherichia coli IAI39
Escherichia coli UMN026
Escherichia coli O83:H1 str.NRG 857C
Escherichia coli O104:H4 str.2011C-3493
点开第一个,找到RefSeq下面的NC_000913.2：
Type Name RefSeq INSDC Size (Mb) GC% Protein rRNA tRNA Other RNA Gene Pseudogene
Chr - NC_000913.2 U00096.2 4.64 50.8 4,145 22 89 65 4,497 181
再进去,找到COMMENT,里面一般会说是什么时候提交的,如下：
COMMENT REVIEWED REFSEQ:This record has been curated by NCBI staff.The
reference sequence is identical to U00096.
On Jun 24,2004 this sequence version replaced gi:16127994.
比如你搜索Escherichia coli吧
在genomes里面会出现：
1 Genome:genome sequencing projects by organism
点1进去,出现：
Reference genomes:[see all organisms]
Escherichia coli str.K-12 substr.MG1655
Escherichia coli O157:H7 str.Sakai
Escherichia coli IAI39
Escherichia coli UMN026
Escherichia coli O83:H1 str.NRG 857C
Escherichia coli O104:H4 str.2011C-3493
点开第一个,找到RefSeq下面的NC_000913.2：
Type Name RefSeq INSDC Size (Mb) GC% Protein rRNA tRNA Other RNA Gene Pseudogene
Chr - NC_000913.2 U00096.2 4.64 50.8 4,145 22 89 65 4,497 181
再进去,找到COMMENT,里面一般会说是什么时候提交的,如下：
COMMENT REVIEWED REFSEQ:This record has been curated by NCBI staff.The
reference sequence is identical to U00096.
On Jun 24,2004 this sequence version replaced gi:16127994.