求高人指教,关于生物信息学中NCBI数据库的blastn的用法.
来源:学生作业帮 编辑:大师作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/11/12 09:52:05
求高人指教,关于生物信息学中NCBI数据库的blastn的用法.
这里有一段基因序列CTGAAATGTGGAGTCAAACCTTGTACTAAGTTGGGCAATGTGGGAGCAGGAACAAAATGGTCCTTGGCCTCATAAGTGTTTTACTGTCTGGGCCCGTGACTGGCCAAGTGACCCTCAGCCTGAGTAGCTGGAGTGGTAAGTCAGTGACATGGCAGGAACATCCAGCATCATGCGACTGCTTCTATGTAAACCCTGTATAACTGGGTGGGGGAGGAAAGATGCTGAGGGTGCTGGGTGGGGACCAGCACTGAACTGTCAGCAAGGGATGAAACTGGGCAGTTCTCCACTCACCTTGTTGGGC;要通过NCBI数据库中的blastn寻找与其相似度最高的属于鸡的基因序列,并得到鸡的基因序列的编号:GENE ID,用于在GO数据库中通过输入基因编号找到其功能和所在的代谢过程.但是我在blastn中找不到鸡的基因序列的编号,求高人指教,(如果有截图更好)
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你进了NCBI的blast页面之后,粘贴进去序列,下面的program selection 选择第三个.结果中有一个“Gallus gallus”,即是家鸡了(应该是从上面数第二个结果).
再问: 谢谢您的回答!我在tblastn中找上面一段序列对应的蛋白质名称时总是提示错误:Message ID#24 Error: Failed to read the Blast query: Nucleotide FASTA provided for protein sequence。请问是怎么回事?再次谢谢了!急用!
再问: 谢谢您的回答!我在tblastn中找上面一段序列对应的蛋白质名称时总是提示错误:Message ID#24 Error: Failed to read the Blast query: Nucleotide FASTA provided for protein sequence。请问是怎么回事?再次谢谢了!急用!